La espectrometría de masas nativa puede predecir eficazmente la eficacia de PROTAC
Por Waters Corporation
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Resumen del Evento
Esté preparado y asegúrese de leer: La espectrometría de masas nativa puede predecir eficazmente la eficacia de PROTAC
Nos acompañará la Dra. Rebecca Beveridge de la Universidad de Strathclyde, una profesora titular con amplia experiencia en el desarrollo de métodos de espectrometría de masas de movilidad iónica nativa para estudiar proteínas y complejos proteicos.
Este artículo describe cómo se puede utilizar el SYNAPT MS de Waters para demostrar la fortaleza de la espectrometría de masas nativa para delinear los complejos mecanismos de unión de los degradadores de proteínas, que involucran la formación de complejos proteína-ligando de tres componentes.
Objetivo clave de Aprendizaje
- Debate sobre algunos de los artículos más actuales, desde los favoritos de todos los tiempos hasta algunos de los últimos lanzamientos.
- Concéntrese en comprender el beneficio de SYNAPT MS y cómo aprovechar al máximo el sistema para la espectrometría de masas nativa y el análisis de biomoléculas.
- Obtenga una mayor comprensión de las aplicaciones y tecnologías haciendo preguntas a los autores y/o al panel de expertos.
- No hay contenido pregrabado, los autores estarán EN VIVO y frente a la cámara para responder preguntas.
Resumen: Los degradadores de proteínas, también conocidos como quimeras dirigidas a la proteólisis (PROTAC), son pequeñas moléculas bifuncionales que promueven la degradación celular de una proteína de interés (POI). Los PROTAC actúan como mediadores moleculares, acercando una ligasa E3 y una POI, promoviendo así la ubiquitinación y degradación de la POI deseada. A pesar de su gran promesa como fármacos farmacéuticos de próxima generación, el desarrollo de nuevos PROTAC se ve desafiado por la complejidad del sistema, que involucra interacciones binarias y ternarias entre componentes. Aquí, demostramos la fortaleza de la espectrometría de masas nativa (nMS), una técnica sin etiquetas, para proporcionar una nueva perspectiva de las interacciones proteicas mediadas por PROTAC. Mostramos que la nMS puede monitorear la formación de complejos ternarios E3-PROTAC-POI y detectar varias especies intermediarias en un solo experimento. Un beneficio único del método es su capacidad de revelar combinaciones E3-PROTAC-POI formadas preferentemente en experimentos de competencia con múltiples proteínas de sustrato, posicionándolo así como una estrategia de detección de alto rendimiento ideal durante el desarrollo de nuevos PROTAC.
Dra. Rebecca Beveridge
Científica Principal, Corporación Waters
Rebecca es profesora titular y becaria del programa Future Leaders de UKRI que se incorporó a la Universidad de Strathclyde en junio de 2020 como becaria del Canciller. Obtuvo una licenciatura en bioquímica y química en la Universidad de Leeds en 2011 y completó su doctorado en la Universidad de Manchester en 2015. Rebecca pasó 4 años en el Instituto de Patología Molecular de Viena (Austria) como investigadora postdoctoral/becaria postdoctoral Lise Meitner. A lo largo de su carrera, ha adquirido experiencia en una gran cantidad de métodos de espectrometría de masas para estudiar la estructura de las proteínas, como la espectrometría de masas nativa, la movilidad iónica, el intercambio de hidrógeno y deuterio y la reticulación.
La investigación actual de Rebecca se centra en el desarrollo de métodos de espectrometría de masas de movilidad iónica nativa para estudiar proteínas y complejos de proteínas, particularmente aquellos que son difíciles de estudiar con métodos de bioquímica convencionales.
Estos sistemas incluyen proteínas intrínsecamente desordenadas que existen en una amplia gama de formas diferentes y complejos proteicos formados por moléculas que degradan proteínas, como PROTAC, cuyos modos de unión complejos son difíciles de delinear.